林孕昌(允昌、胤昌)字为磐，号素庵，泉州浮桥人。生于明万历廿三年(公元1595)，少年好学，万历四十三年（1615)年方二十中举，天启二年登进士第。初授南京户部广东司主事，专管文武各官的俸盐和淮浙、山东、福建各盐引的用印。任內廉洁奉公。嗣后出任南京兵部主事。由于严整军纪，善于处理标营卫总克剥军粮之弊，使兵将畏惮，上司信服。
    天启五年(1625)初，孕昌以点马差便道回乡省亲，因见当时吏治腐败，产生终养父母的念头，故土司屡催仍不赴任。是年九月，上司．欲调他任南京吏部考功清吏司任职，恰逢其父病逝而在家守制。三年服期满催檄迭至，迨崇祯元年他才上北京赴任．旋调验方司掌管司印，主持常务工作。
    是时，弄权乱政的宦官魏忠贤败落，孕昌积极为遭魏党迫害惨死者的后人题复赠荫，又为东林党顾宪成等加赠荫子，以励理学节义之臣。
    崇祯五年(1632)孕昌擢任稽勋清吏司郎中，给假省亲。他在笋江畔建在兹堂，在清源山南台建纶恩、雷荐二亭，又重辟西洞天唐代林藻、林蕴读书处。翌年于在兹堂讲学，为理学的发展作贡献。是年冬在泉州奉圣铺建宅第，取名“栖绿园”。
    崇祯七年，与蒋德璟大力倡导旦气学，门徒众多，连知府樊维成、县令戈简都去听讲。
    崇祯十三年，他重建清源山西洞天偕乐亭，题匾曰“海邦所瞻”。落咸之日，他与知府孙朝让登临赋诗以誌纪念。
    崇祯十六年，吏部尚书李遇知荐孕昌荐任考功清吏司郎中，因该职未缺没赴任。
    崇祯十七年，思宗自杀，福王朱由崧在南京即位，吏部尚书徐石麒荐孕昌，但遭妒忌者所阻。改擢任南京通政使司右通政，孕昌推乱不去。翌年，清兵陷南京，唐王朱聿键即位福州，推孕昌为兵部右侍郎，继而荐任太常寺正卿，他坚决辞绝。
    顺治三年，清兵攻克福州，进入泉州，其时孕昌在雁山为母守庐墓。顺治八年正月廿九日孕昌诞辰，诸弟子镌刻其石像立于清源山八仙阁，参加庆寿者百余人。
    顺治九年，孕昌又在栖绿园洁身堂讲学，听讲者更为广泛。翌年，直指使者王应元上疏推荐，孕昌奉旨恢复原职，考核酌用。
    顺治十四年春旱灾严重，孕昌三次在蛻岩为百姓祈雨。二月孕昌逝于家，年63岁。身后，“笥中仅遗笔五矢、墨二函、履二只”。翌年，郡绅士公举孕昌设特祠以祭祀。顺治十七年春，迎孕昌牌位于晋江县学左侧旦气堂里。
    孕昌著作甚丰，为后人所推崇的有《茧草经史耨义》、《论语耨义》、《周易口占》、  《旦气记录內篇》、  《泉山小志》、《春秋总论》、《续尚书》等书。
    王丽水据《鲤城人物志》整理